爲了製造出適合陪伴人類的海洋夥伴寵物，由海嘯女士帶領的靴子實驗室抓走了比奇堡的所有居民，海綿寶寶和松鼠珊迪·奇克斯爲了拯救比奇堡決心前往人類世界，開啓了驚心動魄的冒險旅程。海綿寶寶和珊迪在得州被響尾蛇攻擊，珊迪的家人們挺身而出幫二人脫險，並護送二人到了靴子實驗室。 在實驗室里衆人目睹了海嘯女士的邪惡計劃，海綿寶寶作爲邪惡克隆計劃的犧牲品被抓走命懸一線。在危急關頭，珊迪發揮自己的聰明才智，在章魚哥、派大星、蟹老闆等比奇堡朋友們和奇克斯家人們的幫助下，排除萬難成功阻止了海嘯女士的克隆計劃。