本片講述了一夜之間二十七具屍體被懸掛當街，且都被抽去了骨頭，死相詭譎。向來不信邪的宋慈以一種追求極致真相的態度與女助手雨墨深入調查。通過對死者關係網的盤查，宋慈發現這是起隨機殺人案，有價值的是「27」這個數字，這與十年前的波旬教案有關，他向恩師耿知年請教，誰知當天二十七具屍體就在府衙中自燃，雖灰飛煙滅卻有跡可尋，宋慈不得不懷疑這一切正和當年負責波旬教案的耿知年有關。與此同時，懷揣著隱祕身世的雨墨也已漸漸接近「真相」，那是她同樣無法接受的真相……