《小長門有希的消失》是基於曾經《涼宮春日的消失》的設定及世界觀爲基礎。由外傳《小涼宮春日的憂鬱》的作者ぷよ以長門有希爲主角及視野從長門進行的另一種可能性發展的外傳漫畫作品。描寫「感情豐富、文靜害羞少女」的長門有希與阿虛的戀愛喜劇故事。2013年12月18日宣布進行動畫製作企劃。2015年4月至7月播出電視動畫，全16話。 故事和人物設定維持《涼宮春日系列》原作小說的基本設定，但與原作小說不同的是，「長門有希和朝倉涼子是外星人」、「朝比奈實玖瑠是未來人」、「古泉一樹是超能力者」、「涼宮春日想許的願望必定會實現的能力」這些特殊能力的設定均刪除，取而代之的是所有人物和阿虛一樣都是普通的人類。