戰國時代──以恐怖來統治天下最凶最惡的武將「牙鬼幻月」。由「伊賀崎家」率領的一羣忍者，經過激烈的戰鬥，打倒了「牙鬼幻月」。 但「牙鬼幻月」卻留下了不詳的預言… 「444年後，我將變成妖怪復活再次以恐怖支配天下！」時光流逝—— 終結忍者「伊賀崎好天」跟復活的妖怪「牙鬼幻月」決鬥，並成功將它封印。時光再次流逝到了現代──「牙鬼幻月」的封印被解除， 「牙鬼幻月」的怨念生出了一批妖怪，這些妖怪們組成「牙鬼軍團」， 爲了讓「牙鬼幻月」完全復活，妖怪們到處搜集人們的恐懼心，開始向人們展開襲擊！緊急時刻，出現了5個年輕人。 他們正是伊賀崎家的末裔，也就是終結忍者・伊賀崎好天的孫子們！「當忍則忍，可不忍則不忍！」 三代同堂，用火熱的「忍者心」（Nintality）以及各種異想天開的忍術來漂亮的擊退妖怪！爲了繼承祖父的「終結忍者」這個封號，也爲了阻止妖怪軍團讓「牙鬼幻月」復活， 他們不僅不忍，還要大肆反擊！