特工格雷格里奧（安東尼奧•班德拉斯 Antonio Banderas 飾）和英格麗德（卡拉•古奇諾 Carla Gugino 飾）是世界上最頂尖的特工，兩人在一次任務中相遇，然後就一發不可收拾的墮入了愛河，從此世界上就少了兩名出色的特工，多了一個幸福的家庭。一晃眼九年過去了，平靜的世界再起波瀾，格雷格里奧以前的戰友們一個接一個神祕失蹤，這一定是陰謀分子又在興風作浪。無奈之下，格雷格里奧和英格麗德只好再度出馬，不料兩人亦同樣遭到綁架！這下，重擔只能落在兩個從小生長在特工之家的小鬼卡門（亞歷克斯•維加 Alexa Vega 飾）和朱尼（達里爾•沙巴拉 Daryl Sabara 飾）身上，我們的特工神童出征了。